RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 RAB18Q9NP72 206 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 DPM3Q9P2X0 92 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 GHRLQ9UBU3 117 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 C15orf65H3BRN8 121 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 SLC22A1O15245 554 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 DENRO43583 198 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 MT-ND4P03905 459 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 UBBP0CG47 229 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 HSMCR30P0CW71 290 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 KIR2DS4P43632 304 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 GABARAPL2P60520 117 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 QRFPP83859 136 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 FABP5Q01469 135 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TRAM1Q15629 374 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 SSX1Q16384 188 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF367Q7RTV3 350 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OR10A7Q8NGE5 316 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 NDNFQ8TB73 568 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 SELENOIQ9C0D9 397 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF696Q9H7X3 374 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 FBLN5Q9UBX5 448 aa9□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 LEUTXA8MZ59 168 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TSPAN15O95858 294 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 GLAP06280 429 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 NFYBP25208 207 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 GABRA5P31644 462 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 EFNB2P52799 333 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 UNC119Q13432 240 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 RAB12Q6IQ22 244 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM219Q86XT9 240 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 Q8N2B8 174 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OR9G1Q8NH87 305 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 RFESDQ8TAC1 157 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 FAM46BQ96A09 425 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 RHOVQ96L33 236 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CST11Q9H112 138 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 MMP28Q9H239 520 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF702PQ9H963 129 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 PSG11Q9UQ72 335 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 J3QR06 171 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 AIPO00170 330 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 F2RL2O00254 374 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ORC5O43913 435 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 PDCD6O75340 191 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 MPIG6BO95866 241 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 GZMHP20718 246 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 FUT3P21217 361 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 HTR2CP28335 458 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 PRRX1P54821 245 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 LOXL3P58215 753 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OR10K2Q6IF99 312 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 NEK7Q8TDX7 302 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC107Q8WV48 283 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 LEAP2Q969E1 77 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TM2D1Q9BX74 207 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 KCNK15Q9H427 330 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ETAA1Q9NY74 926 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 NOTCH1P46531 2555 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 OOSP1A8MZH6 123 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 C12orf77C9JDV5 145 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 SLC17A2O00624 439 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 TOR1AO14656 332 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CA11O75493 328 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 ARL6IP5O75915 188 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CHATP28329 748 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 CEACAM3P40198 252 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 LTC4SQ16873 150 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-211ENST00000590499 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms