RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6G6FQ5SQ64 297 aa18.97■□□□□ 0.63
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZNRF1Q8ND25 227 aa18.97■□□□□ 0.63
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR13A1Q8NGR1 328 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-207ENST00000589146 COQ8AQ8NI60 647 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CASTOR1Q8WTX7 329 aa18.97■□□□□ 0.63
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CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR2T35Q8NGX2 323 aa18.93■□□□□ 0.62
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CAPNS1-207ENST00000589146 PHLDA2Q53GA4 152 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR18Q8N4B5 295 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM216BQ8N7L0 139 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LRTM2Q8N967 370 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 BVESQ8NE79 360 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM216AQ8WUB2 273 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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