RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 OR13C7P0DN81 318 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 GZMBP10144 247 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TBPP20226 339 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 BCL3P20749 454 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 OSR2Q8N2R0 312 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SLC30A7Q8NEW0 376 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 NINJ1Q92982 152 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 STRADBQ9C0K7 418 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 HSBP1L1C9JCN9 74 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TNFSF12O43508 249 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 IL18BPO95998 194 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 MPZP25189 248 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 BMI1P35226 326 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R31P59538 309 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RPS23P62266 143 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 GCNT2Q8N0V5 402 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 KCNE4Q8WWG9 221 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CXCL1P09341 107 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 LHX2P50458 406 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CEBPGP53567 150 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ABCA11PQ4W5N1 156 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H2BLQ99880 126 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TM2D1Q9BX74 207 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 HS3ST1O14792 307 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SYNGR1O43759 233 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 HLA-GP17693 338 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CHATP28329 748 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 C1QL4Q86Z23 238 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CBY3A6NI87 242 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 FAM157AC9JC47 383 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SP9P0CG40 484 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CD59P13987 128 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CLDN18P56856 261 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RAB1AP62820 205 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SPIN3Q5JUX0 258 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 FAHD2AQ96GK7 314 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ANAPC10Q9UM13 185 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF728P0DKX0 622 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF708P17019 499 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 FHITP49789 147 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RNFT1Q5M7Z0 435 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 POC1AQ8NBT0 407 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 OR52M1Q8NGK5 317 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 OR1J1Q8NGS3 322 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RDH5Q92781 318 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ERGIC1Q969X5 290 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 GALNT14Q96FL9 552 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 C2orf50Q96LR7 162 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CYB5BO43169 146 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 C1QL1O75973 258 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SCTP09683 121 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 OR5I1Q13606 314 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZRG5 221 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 FAM122AQ96E09 287 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TXN2Q99757 166 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 NMES1Q9C002 83 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 RAB18Q9NP72 206 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TRGC1P0CF51 173 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 AADACP22760 399 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PRDX4Q13162 271 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 HES3Q5TGS1 186 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF100Q8IYN0 542 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SPSB1Q96BD6 273 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 SNX22Q96L94 193 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF732B4DXR9 585 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 OMGP23515 440 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 OR3A1P47881 315 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 PRSS54Q6PEW0 395 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms