RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452		J3QT63	122 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	UBD	O15205	165 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	HDAC3	O15379	428 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	AHSA1	O95433	338 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	APOE	P02649	317 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	CXCR1	P25024	350 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	SSTR5	P35346	364 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	CTRL	P40313	264 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	CXCL5	P42830	114 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	UBE2A	P49459	152 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	BLVRA	P53004	296 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	AQP5	P55064	265 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	RHOA	P61586	193 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	IL5RA	Q01344	420 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	CYP24A1	Q07973	514 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ERCC8	Q13216	396 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	MED21	Q13503	144 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	OTP	Q5XKR4	325 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF544	Q6NX49	715 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	LFNG	Q8NES3	379 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	OR2L5	Q8NG80	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF488	Q96MN9	340 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	NAGK	Q9UJ70	344 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	BTRC	Q9Y297	605 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BBS2-215	ENST00000566452	DSCAM	O60469	2012 aa		2.59	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		2.59	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TAAR5	O14804	337 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PSPHP1	O15172	72 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RAB36	O95755	333 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGLV3-27	P01718	113 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HLA-DRA	P01903	254 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ORM1	P02763	201 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CA5A	P35218	305 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	APLNR	P35414	380 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MAGEA2	P43356	314 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TTPA	P49638	278 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PSMB2	P49721	201 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TAS2R31	P59538	309 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	INCA1	Q0VD86	236 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NAB1	Q13506	487 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TTC32	Q5I0X7	151 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HHAT	Q5VTY9	493 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	XKRX	Q6PP77	449 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LGI3	Q8N145	548 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GAPT	Q8N292	157 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LINC01006	Q8NI28	216 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PIFO	Q8TCI5	191 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CDS1	Q92903	461 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR2M4	Q96R27	311 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RBBP8	Q99708	897 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	APOL4	Q9BPW4	351 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RSG1	Q9BU20	258 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TMED9	Q9BVK6	235 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	UCK1	Q9HA47	277 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LHX9	Q9NQ69	397 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		2.58	□□□□□ -2

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