RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 NAPSAO96009 420 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 FUT3P21217 361 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 NFYBP25208 207 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 DYNLT3P51808 116 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GPR176Q14439 515 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAM1Q15629 374 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM189A2Q15884 450 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 MINOS1Q5TGZ0 78 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR52W1Q6IF63 320 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR6M1Q8NGM8 313 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 THRSPQ92748 146 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 CENPOQ9BU64 300 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 SERTAD4Q9NUC0 356 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ETAA1Q9NY74 926 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GHRLQ9UBU3 117 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 V9GY05 133 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ORC5O43913 435 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 SMIM18P0DKX4 95 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GADD45AP24522 165 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 PSMB9P28065 219 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 HTR1DP28221 377 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GNG10P50151 68 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ARL11Q969Q4 196 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM3DQ96BQ1 224 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 CITED1Q99966 193 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 MMP28Q9H239 520 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 DPM3Q9P2X0 92 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 RNF114Q9Y508 228 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 IFITM5A6NNB3 132 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 AIPO00170 330 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB27BO00194 218 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 PROP1O75360 226 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 HBZP02008 142 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 UBBP0CG47 229 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GALP22466 123 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 NEDD8Q15843 81 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 Q8N2B8 174 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR52L2PQ8NGH6 319 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR9G1Q8NH87 305 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 YIPF6Q96EC8 236 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 TAF9BQ9HBM6 251 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 AK3Q9UIJ7 227 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ARL6IP5O75915 188 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GLAP06280 429 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ARSBP15848 533 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 GZMHP20718 246 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 KIR2DS4P43632 304 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 VEGFCP49767 419 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 HMGN3Q15651 99 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB11BQ15907 218 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 SVOPQ8N4V2 548 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00311Q8N616 119 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 NDNFQ8TB73 568 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 PECRQ9BY49 303 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 CST11Q9H112 138 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 STUB1Q9UNE7 303 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 SDC2P34741 201 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 HERPUD1Q15011 391 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 MORN2Q502X0 79 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 PRR31Q5SQ13 230 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 OR52M1Q8NGK5 317 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 NEK7Q8TDX7 302 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms