RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 DTX3Q8N9I9 347 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 CFHR4Q92496 578 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 RPEQ96AT9 228 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TM2D1Q9BX74 207 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 A0A0A6YYD4 124 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SLC17A2O00624 439 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 ARL6IP5O75915 188 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 BPNT1O95861 308 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MNDAP41218 407 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MADCAM1Q13477 382 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 C6orf183Q5T699 404 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 NICN1Q9BSH3 213 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OR2F2O95006 317 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TSPAN15O95858 294 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 HBZP02008 142 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 P2RY14Q15391 338 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 LINC00311Q8N616 119 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OR1L1Q8NH94 360 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 H3BUI4 141 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SLC31A2O15432 143 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 AMY1AP04745 511 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 AMY2AP04746 511 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 RAB7AP51149 207 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 Q3ZCU0 254 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OR8H3Q8N146 312 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OR56B4Q8NH76 319 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 Q9H521 79 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SHISA3A0PJX4 238 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 HSD17B6O14756 317 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SPINT2O43291 252 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 Q6ZPA2 131 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 Q6ZTK2 550 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 SPARTQ8N0X7 666 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 DRAM1Q8N682 238 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 MMP27Q9H306 513 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-219ENST00000550655 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 ARSBP15848 533 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 CLDN12P56749 244 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 RAB11BQ15907 218 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 PRR18Q8N4B5 295 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 SVOPQ8N4V2 548 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-219ENST00000550655 RAB9BQ9NP90 201 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms