RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 V9GY05 133 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NDX4 124 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC17A2O00624 439 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 HSD17B6O14756 317 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC22A1O15245 554 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPA12AO43301 675 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FGF16O43320 207 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM127O75204 238 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO24O75426 580 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SC5DO75845 299 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V1G2O95670 118 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 LALBAP00709 142 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV1-47P01700 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MT-ND4P03905 459 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5H8P0DN80 308 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM11P17152 192 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CD1BP29016 333 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PROK1P58294 105 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 HTD2P86397 168 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CBX3Q13185 183 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 P2RY14Q15391 338 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 LTC4SQ16873 150 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MOB3BQ86TA1 216 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TPRA1Q86W33 373 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8N2B8 174 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR18Q8N4B5 295 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2T10Q8NGZ9 312 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RFESDQ8TAC1 157 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC107Q8WV48 283 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM203Q969S6 136 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM46BQ96A09 425 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 COQ2Q96H96 371 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 Q96M66 194 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 BANF2Q9H503 90 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 JPT1Q9UK76 154 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB22AQ9UL26 194 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 HSF4Q9ULV5 492 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SSR3Q9UNL2 185 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PSG11Q9UQ72 335 aa4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2QL1A1L167 161 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINE3A8MV23 424 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MOSP00540 346 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 HBZP02008 142 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CD3GP09693 182 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CGB3P0DN86 165 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CGB7P0DN87 165 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 VSIG8P0DPA2 414 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB3BP20337 219 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB25P24278 435 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMB9P28065 219 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CD40LGP29965 261 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MC5RP33032 325 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SSTR5P35346 364 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TALDO1P37837 337 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINB10P48595 397 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 GNG10P50151 68 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 EFNB2P52799 333 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 DLX1P56177 255 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RELBQ01201 579 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 IRF3Q14653 427 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR2DS1Q14954 304 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM219Q86XT9 240 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf50Q8WW18 174 aa4.51□□□□□ -1.69
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