RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa13.29□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 H0YHG0 523 aa13.29□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 CCL24O00175 119 aa13.29□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 CD1BP29016 333 aa13.29□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RAB25P57735 213 aa13.29□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 STX19Q8N4C7 294 aa13.29□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 S1PR3Q99500 378 aa13.29□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 GON7Q9BXV9 100 aa13.29□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 C12orf77C9JDV5 145 aa13.28□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 GPX5O75715 221 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 MOSP00540 346 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 MYL12AP19105 171 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 DGCR2P98153 550 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 GPR50Q13585 617 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 DEFB136Q30KP8 78 aa13.28□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 Q499Y3 187 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZFP41Q8N8Y5 198 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 OR4K15Q8NH41 348 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 TFAP2CQ92754 450 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 CKLFQ9UBR5 152 aa13.28□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 DNAH9Q9NYC9 4486 aa13.28□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 COL7A1Q02388 2944 aa13.27□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPK0 400 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 IRGMA1A4Y4 181 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SPINT2O43291 252 aa13.27□□□□□ -0.29
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF134P52741 427 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 F2RL1P55085 397 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GPR176Q14439 515 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 YIF1BQ5BJH7 314 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR10V1Q8NGI7 309 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MUL1Q969V5 352 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 HSPB9Q9BQS6 159 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ETAA1Q9NY74 926 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GNG12Q9UBI6 72 aa13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 TXNL1O43396 289 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ELANEP08246 267 aa13.26□□□□□ -0.29
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HERC3-211ENST00000513325 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 LUMP51884 338 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZNF137PP52743 207 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FOXE3Q13461 319 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS1Q14954 304 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CT45A1Q5HYN5 189 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RAB12Q6IQ22 244 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 PRR18Q8N4B5 295 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 JAGN1Q8N5M9 183 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RNF152Q8N8N0 203 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR8H1Q8NGG4 311 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR8U1Q8NH10 309 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR1L1Q8NH94 360 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CT45A3Q8NHU0 189 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 TMEM80Q96HE8 168 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RDH12Q96NR8 316 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RAB9BQ9NP90 201 aa13.26□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
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HERC3-211ENST00000513325 VSIG8P0DPA2 414 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SOX6P35712 828 aa13.25□□□□□ -0.29
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HERC3-211ENST00000513325 C6orf183Q5T699 404 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 AWAT2Q6E213 333 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZNF485Q8NCK3 441 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 PGLYRP3Q96LB9 341 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR14A2Q96R54 314 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 BANF2Q9H503 90 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 PEX16Q9Y5Y5 336 aa13.25□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RAMP3O60896 148 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MAS1P04201 325 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FSTP19883 344 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 VDAC1P21796 283 aa13.24□□□□□ -0.29
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