RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276		H0Y980	276 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	RGS11	O94810	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	APOF	Q13790	326 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CHST4	Q8NCG5	386 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPB6	O14558	160 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	DEGS1	O15121	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SYT7	O43581	403 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SOX15	O60248	233 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINA3	P01011	423 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SSTR5	P35346	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MTCP1	P56278	107 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	EFNB1	P98172	346 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PN81	502 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	KDM4B	O94953	1096 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	GABRB1	P18505	474 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CHRNA7	P36544	502 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CXCR4	P61073	352 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MMD	Q15546	238 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM106A	Q96A25	262 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	RFT1	Q96AA3	541 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC182	A6NF36	153 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	PRKY	O43930	277 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CNIH1	O95406	144 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MED14OS	P0DP75	135 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB40B	Q12829	278 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CDK5R1	Q15078	307 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276		M0R129	80 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IL3RA	P26951	378 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276		Q96MT0	163 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	TXNL1	O43396	289 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	ATF1	P18846	271 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	PRKACB	P22694	351 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	CD81	P60033	236 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM53C-208	ENST00000511276	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		10.03	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms