RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYNLT3P51808 116 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FUT6P51993 359 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MLF1P58340 268 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAC3P60763 192 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRYQ05066 204 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF154Q13106 437 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL13RA2Q14627 380 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HERPUD1Q15011 391 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR10D3Q8NH80 312 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EXTL1Q92935 676 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DOCK7Q96N67 2140 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A0A0G2JRQ6 117 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 H3BP45 60 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHV2-5P01817 119 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFIP05156 583 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FGF5P12034 268 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RND3P61587 244 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NHLH1Q02575 133 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GNMTQ14749 295 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF212Q495C1 297 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACER2Q5QJU3 275 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF695Q8IW36 515 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRRG4Q9BZD6 226 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR35Q9HC97 309 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRFN1Q9P244 771 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MIOXQ9UGB7 285 aa5.6□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHST1O43916 411 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR2C1O95371 312 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HLA-HP01893 362 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CXCL1P09341 107 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAX6P26367 422 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OTX2P32243 289 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HAAOP46952 286 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LPAL2Q16609 132 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBALD1Q8TB05 177 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YPEL4Q96NS1 127 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR51B6Q9H340 312 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARGFXA6NJG6 315 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A20A6NK97 555 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFITM10A6NMD0 228 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 H3BQ15 152 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HS3ST1O14792 307 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YKT6O15498 198 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYNGR1O43759 233 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NGFP01138 241 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAX9P55771 341 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UCP3P55916 312 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HMGN3Q15651 99 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EXT1Q16394 746 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MLANAQ16655 118 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPINK14Q6IE38 97 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COMMD1Q8N668 190 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 M1APQ8TC57 530 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAB39BQ96DA2 213 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LOXL4Q96JB6 756 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TUBA4BQ9H853 241 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR54Q9H977 334 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CALHM2Q9HA72 323 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM186AA6NE01 2351 aa5.59□□□□□ -1.51
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.58□□□□□ -1.52
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.1 ms