RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 CLDN14O95500 239 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FCGR3AP08637 254 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A4P12235 298 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CCL11P51671 97 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PRDX4Q13162 271 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ARL6IP1Q15041 203 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR8B8Q15620 311 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TMEM42Q69YG0 159 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TMEM45BQ96B21 275 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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HERC4-211ENST00000492996 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 AHRRA9YTQ3 701 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 DLEU1O43261 78 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 LILRA1O75019 489 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SCGB1D2O95969 90 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RAB5AP20339 215 aa5.99□□□□□ -1.45
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HERC4-211ENST00000492996 FCGR2CP31995 323 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 MALLQ13021 153 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ASB13Q8WXK3 278 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF488Q96MN9 340 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 GPHA2Q96T91 129 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RGCCQ9H4X1 137 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 GTF3C1Q12789 2109 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF732B4DXR9 585 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ACTL6AO96019 429 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FOLR2P14207 255 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FABP4P15090 132 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PIGPP57054 158 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PLP2Q04941 152 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 BATFQ16520 125 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF766Q5HY98 468 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 MGAQ8IWI9 3026 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R2P9O14990 202 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TGOLN2O43493 480 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CIDEAO60543 219 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PDCD6O75340 191 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FAM87AP0C7U9 286 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF728P0DKX0 622 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HOXC12P31275 282 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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HERC4-211ENST00000492996 TMED6Q8WW62 240 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SEC11CQ9BY50 192 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RAB18Q9NP72 206 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 A6NNC1 897 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 K7EM74 188 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SYNGR1O43759 233 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SMPD2O60906 423 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FSTL3O95633 263 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 IGHV2-5P01817 119 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ARG1P05089 322 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HEXAP06865 529 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CD200P41217 278 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF345Q14585 488 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 Q5PR19 223 aa5.98□□□□□ -1.45
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HERC4-211ENST00000492996 OR2A2Q6IF42 318 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RAB24Q969Q5 203 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C2orf50Q96LR7 162 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 NMES1Q9C002 83 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 GLRX2Q9NS18 164 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ROS1P08922 2347 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ACACAQ13085 2346 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A20A6NK97 555 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FUT3P21217 361 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.97□□□□□ -1.45
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