RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL7	P13232	177 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAO	P14920	347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FUT3	P21217	361 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLRA1	P23415	457 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTC	P35070	178 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFX2	P48378	723 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF45	Q02386	682 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCN1B	Q07699	218 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL18	Q14116	193 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HACD4	Q5VWC8	232 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB12	Q6IQ22	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZTK2	550 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAPT	Q8N292	157 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF525	Q8N782	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHST4	Q8NCG5	386 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERGIC1	Q969X5	290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDSL	Q96GA7	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHST6	Q9GZX3	395 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CST11	Q9H112	138 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPA2	Q9H2U2	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DECR2	Q9NUI1	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF69	Q9UC07	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSF4	Q9ULV5	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MED13L	Q71F56	2210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0A6YYH2	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OOEP	A6NGQ2	149 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NJ64	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEGS1	O15121	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIGLEC5	O15389	551 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPK1B	O75841	260 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDT3	O95989	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT-ND4	P03905	459 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAX1	P15863	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPT2	P23786	658 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6	3e-28	■□□□□ 10.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL2RG	P31785	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A5	P33763	92 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NR4A2	P43354	598 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLIPR1	P48060	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFNA4	P52798	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMO4	P61968	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAMP2	P63027	116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR176	Q14439	515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF846	Q147U1	533 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERPUD1	Q15011	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPV17L	Q2QL34	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYDC2	Q56P42	97 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4K15	Q8NH41	348 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBALD1	Q8TB05	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPF1	Q92782	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHOF	Q9HBH0	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASL12	Q9NYN1	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPTN	Q9Y639	398 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.7 ms