RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PTX4	Q96A99	478 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CGB3	P0DN86	165 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CGB7	P0DN87	165 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC119	Q13432	240 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX2	Q16385	188 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6E	Q16553	131 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	VWF	P04275	2813 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGN	O76038	276 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MT-ND4	P03905	459 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK2	P24941	298 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	BRS3	P32247	399 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CEACAM3	P40198	252 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	VEGFC	P49767	419 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRX1	P54821	245 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAND1	P57086	179 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TOR1A	O14656	332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINT2	O43291	252 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ORC5	O43913	435 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1A	P01583	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CHAT	P28329	748 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST1	O43916	411 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NFYB	P25208	207 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	F2RL2	O00254	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SOCS1	O15524	211 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CSF1	P09603	554 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB10	P48595	397 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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