RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, human

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRPPRC-208	ENST00000472420	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q9N2K0	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		A8MWP6	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	FCN1	O00602	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR3A3	P47888	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF137P	P52743	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ATP1B3	P54709	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q9H3A6	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	LPA	P08519	4548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RRH	O14718	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	TSPAN4	O14817	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RIPK2	O43353	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ENTPD6	O75354	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	INMT	O95050	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR2H2	O95918	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SEMG1	P04279	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	PYCR1	P32322	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	PLGLA	Q15195	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q8IYB0	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q9H8V8	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRPPRC-208	ENST00000472420		A0A087WUU8	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SH2D1B	O14796	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	APOL3	O95236	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GPX2	P18283	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SSTR5	P35346	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CCL18	P55774	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	KLF10	Q13118	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MED21	Q13503	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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