RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-1.07□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IMMP2LQ96T52 175 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MIEN1Q9BRT3 115 aa-1.07□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-1.07□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 LTAP01374 205 aa-1.09□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 RLN2P04090 185 aa-1.09□□□□□ -2.58
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