RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.52□□□□□ -0.24
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa13.52□□□□□ -0.24
SHQ1-202ENST00000444040 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.52□□□□□ -0.25
SHQ1-202ENST00000444040 NXPH2O95156 264 aa13.52□□□□□ -0.25
SHQ1-202ENST00000444040 OR13C7P0DN81 318 aa13.52□□□□□ -0.25
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