RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 FAHD1Q6P587 224 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SPARTQ8N0X7 666 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 C7orf34Q96L11 122 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TEAD3Q99594 435 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 GNB4Q9HAV0 340 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 CMC2Q9NRP2 79 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 CMTM6Q9NX76 183 aa6.05□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 U3KQV3 271 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 V9GYQ6 96 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 HERC2O95714 4834 aa6.05□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 A0A1W2PPI3 338 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 AQP12BA6NM10 295 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 DEGS1O15121 323 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TXNL1O43396 289 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 RGS10O43665 173 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 HMGN1P05114 100 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 ZP3P21754 424 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 PRKACBP22694 351 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 GLP1RP43220 463 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 OR3A1P47881 315 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 GNG10P50151 68 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 GNB1P62873 340 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 ZNF91Q05481 1191 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 EBI3Q14213 229 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 LTC4SQ16873 150 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 Q8N9W7 124 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 MUL1Q969V5 352 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 RCN3Q96D15 328 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 AMELYQ99218 206 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 FUZQ9BT04 418 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 THTPAQ9BU02 230 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 CST11Q9H112 138 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 MED20Q9H944 212 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 RHOFQ9HBH0 211 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 RAB9BQ9NP90 201 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 FAM206AQ9NX38 181 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.04□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 DPPA5A6NC42 116 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SYT7O43581 403 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 SELENOFO60613 162 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 OR2H2O95918 312 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 CSN2P05814 226 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 ALOX5APP20292 161 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 MTCP1P56278 107 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 MED21Q13503 144 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TMEM42Q69YG0 159 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.03□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 C10orf35Q96D05 121 aa6.03□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.03□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 KIAA1456Q9P272 454 aa6.03□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 PSG11Q9UQ72 335 aa6.03□□□□□ -1.44
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CASP4-201ENST00000393150 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.03□□□□□ -1.44
CASP4-201ENST00000393150 A6NIN4 97 aa6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 ENTPD6O75354 484 aa6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 NDUFB8O95169 186 aa6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 SOX14O95416 240 aa6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 BAG2O95816 211 aa6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 IGLV1-51P01701 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CASP4-201ENST00000393150 IGHV3-7P01780 117 aa6.02□□□□□ -1.45
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