RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 GAB4Q2WGN9 574 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 Q5BKY6 102 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TAF1LQ8IZX4 1826 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CORTO00230 105 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ATP5G2Q06055 141 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 KLRB1Q12918 225 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 BVESQ8NE79 360 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 Q9N2K0 584 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SPINK4O60575 86 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RNF224P0DH78 156 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TAS2R60P59551 318 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAM78BQ5VT40 261 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR2C3Q8N628 320 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR4A5Q8NH83 315 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 C16orf92Q96LL3 132 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CLDN34H7C241 214 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CSN3P07498 182 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 AVPR2P30518 371 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TFPI2P48307 235 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 COL10A1Q03692 680 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MDP1Q86V88 176 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 G6PCP35575 357 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SELENOPP49908 381 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TUBA4BQ9H853 241 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 HELTA6NFD8 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CBY3A6NI87 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 PSG9Q00887 426 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 CTLA4P16410 223 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 KLK11Q9UBX7 282 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 CD1AP06126 327 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MAS1LP35410 378 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM189A5PLL7 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PTP4A3O75365 173 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR2A4O95047 310 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 NHLRC3Q5JS37 347 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-202ENST00000356435 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa4.84□□□□□ -1.63
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