RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 IMMP2LQ96T52 175 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBA4BQ9H853 241 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV3-9P01782 118 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNAB1Q14722 419 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 GABRA6Q16445 453 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 GLRX5Q86SX6 157 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 SP6Q3SY56 376 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 NIT1Q86X76 327 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MGST2Q99735 147 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP25Q9NPA2 562 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP13Q9UII6 198 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP5O75197 1615 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LCTP09848 1927 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PR48 441 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SNURFLB1AK76 121 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 S1PR2O95136 353 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPZBP47756 277 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 ZXDAP98168 799 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 RARRES2Q99969 163 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 PAPPAQ13219 1627 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 H0Y980 276 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 OGG1O15527 345 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LEPROTL1O95214 131 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMPP49913 170 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 WNT3P56703 355 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR31Q8NA23 367 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 C4orf45Q96LM5 186 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM202A6NGA9 273 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFSF11O14788 317 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 ICOSLGO75144 302 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 RDH5Q92781 318 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNL4K9M1U5 179 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 Q5BKY6 102 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT14Q96FL9 552 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 FSTP19883 344 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CA7P43166 264 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 EMDP50402 254 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 EPPINO95925 133 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKN3Q16667 212 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST1H4GQ99525 98 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 JKAMPQ9P055 326 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4C46A6NHA9 309 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 GLI3P10071 1580 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 GLIPR1P48060 266 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SGK494Q96LW2 274 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LY75O60449 1722 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MYBPHQ13203 477 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 GAB4Q2WGN9 574 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CEACAM6P40199 344 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6X1Q8NH79 312 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MYOGP15173 224 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LGALS7P47929 136 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms