RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 S100A7AQ86SG5 101 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 YIPF5Q969M3 257 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MISP3Q96FF7 219 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RQV5 110 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GABARAPH6UMI1 98 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GABARAPO95166 117 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KITLGP21583 273 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 P2RY4P51582 365 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PPP5CP53041 499 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IRF3Q14653 427 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CDK5R1Q15078 307 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PHC2Q8IXK0 858 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DDOQ99489 341 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CHST5Q9GZS9 411 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR2D2Q9H210 308 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 STUB1Q9UNE7 303 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 POM121CA8CG34 1229 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF785A8K8V0 405 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 E9PI62 339 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 H3BMQ9 156 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN4O14817 238 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A1O15245 554 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3DO95716 219 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OPRL1P41146 370 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DLX1P56177 255 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC58Q4VC31 144 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ACSM6Q6P461 480 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PLET1Q6UQ28 207 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 BEST4Q8NFU0 473 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 AQP3Q92482 292 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LALBAP00709 142 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV2-5P01817 119 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FCGR2CP31995 323 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NTF4P34130 210 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 WDR82Q6UXN9 313 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DRAM1Q8N682 238 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ST8SIA2Q92186 375 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PKIBQ9C010 78 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GABRPO00591 440 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LMO1P25800 156 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MC5RP33032 325 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TGFBR1P36897 503 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PMELP40967 661 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CD200P41217 278 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NPBWR2P48146 333 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CAV3P56539 151 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ACTBP60709 375 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1C1Q04828 323 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DOC2BQ14184 412 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NOXA1Q86UR1 476 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf50Q8WW18 174 aa3.7□□□□□ -1.82
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