RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RFLNBQ8N5W9 214 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 OR1L8Q8NGR8 309 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 MS4A3Q96HJ5 214 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 B2MP61769 119 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF714Q96N38 554 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ABCA3Q99758 1704 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 HMSDA8MTL9 139 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00596Q86U02 117 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM251Q8N6I4 163 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 OR2V2Q96R30 315 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 DLK1P80370 383 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 CEBPEQ15744 281 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC2AQ6UVW9 174 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 KLK13Q9UKR3 277 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 MELTFP08582 738 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 AREGP15514 252 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 UCP2P55851 309 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 RIGQ13278 110 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T10Q8NGZ9 312 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 PHYHIPLQ96FC7 376 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ID1P41134 155 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DRB5Q30154 266 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 SCGB1D4Q6XE38 83 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 BVESQ8NE79 360 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 OR2D3Q8NGH3 330 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf91Q3C1V1 193 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 CRISP2P16562 243 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 RBM11P57052 281 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TCTAP57738 103 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF841Q6ZN19 808 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 HELTA6NFD8 242 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 LRP11Q86VZ4 500 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC75AQ8NAA5 344 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf52A6NGY3 159 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF253O75346 499 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TEPPQ6URK8 271 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 HIGD1AQ9Y241 93 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 B4E171 279 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN7P41732 249 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 UCNP55089 124 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ANAPC16Q96DE5 110 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 K7N7A8 449 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 LDLRAD3Q86YD5 345 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 RPL29P47914 159 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 CD300CQ08708 224 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 HIST3H3Q16695 136 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35E3Q7Z769 313 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 OR11H7Q8NGC8 314 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 KIR3DL2P43630 455 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS3P57727 454 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 GUCA2BQ16661 112 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 NCMAPQ5T1S8 102 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZN92 141 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 OR8A1Q8NGG7 326 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD14BQ96IU4 210 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 VAX2Q9UIW0 290 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF519Q8TB69 540 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 CGB1A6NKQ9 187 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 NAT2P11245 290 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 SCN3AQ9NY46 2000 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ERVFRD-1P60508 538 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ATG2BQ96BY7 2078 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV20A0A0B4J274 112 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD2BA6NFX1 497 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 RAB29O14966 203 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS23O95084 383 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 CXorf1O96002 111 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 GABRA6Q16445 453 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF826PQ6ZT77 177 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ANGPTL6Q8NI99 470 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf48Q6RUI8 117 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GU03 582 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ROM1Q03395 351 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ITLN1Q8WWA0 313 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 MCM3APO60318 1980 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 TGIF1Q15583 401 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF11Q5DX21 431 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 FAM214BQ7L5A3 538 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 FAM216AQ8WUB2 273 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms