RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 LYG2Q86SG7 212 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.56□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 PGAM2P15259 253 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 AADACP22760 399 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 KCNJ3P48549 501 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 LIN54Q6MZP7 749 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 MOB3AQ96BX8 217 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.55□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SMLR1H3BR10 107 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 BET1O15155 118 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 C4BPBP20851 252 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 EFNA4P52798 201 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 AESQ08117 197 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 HMGN3Q15651 99 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 DLL4Q9NR61 685 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 KIF25Q9UIL4 384 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.54□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 MED13LQ71F56 2210 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TUSC2O75896 110 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 RGS11O94810 467 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 OR2A4O95047 310 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 PPYP01298 95 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 CTXN2P0C2S0 81 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 GABRA2P47869 451 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 PPOXP50336 477 aa14.53□□□□□ -0.08
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SRSF1-201ENST00000258962 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 PAX5Q02548 391 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 STUMQ69YW2 141 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TOMM40LQ969M1 308 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 OR2A7Q96R45 310 aa14.53□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 PHB2Q99623 299 aa14.53□□□□□ -0.08
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SRSF1-201ENST00000258962 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SLC22A5O76082 557 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TK1P04183 234 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF728P0DKX0 622 aa14.52□□□□□ -0.08
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SRSF1-201ENST00000258962 CD34P28906 385 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 UCP3P55916 312 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 IL13RA1P78552 427 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 KIRREL1Q96J84 757 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 SNX22Q96L94 193 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.52□□□□□ -0.08
SRSF1-201ENST00000258962 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.52□□□□□ -0.08
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SRSF1-201ENST00000258962 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.52□□□□□ -0.08
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SRSF1-201ENST00000258962 DSCR9P59020 149 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HERV-K104P61576 105 aa14.51□□□□□ -0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 MITD1Q8WV92 249 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SDSLQ96GA7 329 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 GON7Q9BXV9 100 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1B0GW55 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OOEPA6NGQ2 149 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.51□□□□□ -0.09
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