RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 PMCHL1Q16048 86 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SLC35B1P78383 322 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FMODQ06828 376 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZNF345Q14585 488 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 INSL4Q14641 139 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 C12orf73Q69YU5 71 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RABAC1Q9UI14 185 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PARP11Q9NR21 331 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CA10Q9NS85 328 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 AMY1AP04745 511 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CD300CQ08708 224 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 DHHO43323 396 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A17O43808 307 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CKS2P33552 79 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 A0A1B0GU03 582 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 HMX2A2RU54 273 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PRSS2P07478 247 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 Q5PR19 223 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PAGE4O60829 102 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ABLIM3O94929 683 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 EPPINO95925 133 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 APELAP0DMC3 54 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FAM53BQ14153 422 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 HLA-DQA1P01909 254 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PR80 420 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 P2RX4Q99571 388 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 NTMQ9P121 344 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 A8MWL6 223 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MT-ND6P03923 174 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PMELP40967 661 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ARF6P62330 175 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 COL19A1Q14993 1142 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MVB12AQ96EY5 273 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 GHITMQ9H3K2 345 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.19□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZNF735P0CB33 412 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FOLR2P14207 255 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 EML5Q05BV3 1969 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TMPRSS2O15393 492 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ST6GAL1P15907 406 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TM4SF20Q53R12 229 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FOXC2Q99958 501 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PAXXQ9BUH6 204 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MMP25Q9NPA2 562 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TMEM189A5PLL7 270 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PPM1DO15297 605 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR4A8P0C604 315 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MAS1LP35410 378 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 IGHV4-34P06331 123 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ECSCRQ19T08 205 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PRR13Q9NZ81 148 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OPN4Q9UHM6 478 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SOD3P08294 240 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR1P1Q8NH06 330 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 HBZP02008 142 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MPLP40238 635 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CCR5P51681 352 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RAC3P60763 192 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FOXB1Q99853 325 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FZD5Q13467 585 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR2V2Q96R30 315 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ASB1Q9Y576 335 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms