RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2010315B03RikJ3QK55 433 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smr2O09133 150 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr142Q60881 305 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf144bQ8BKD6 301 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coq3Q8BMS4 370 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myct1Q8R411 188 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr446Q8VEV0 308 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfand2bQ91X58 257 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vgll1Q99NC0 307 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mdp1Q9D967 164 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sun5Q9DA32 373 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GlceQ9EPS3 618 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Irak1bp1Q9ESJ7 259 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syt9Q9R0N9 491 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gdf15Q9Z0J7 303 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr250E9PV37 331 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2075J3QMW5 144 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A630023A22RikJ3QP60 199 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apoc1P34928 88 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BB287469Q3UT53 144 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NmsQ5H8A1 153 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpne4Q8BLR2 557 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tssk5Q8C1R0 372 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ntng2Q8R4F1 589 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arpc5Q9CPW4 151 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl49Q9CQ40 166 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il36bQ9D6Z6 183 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mdh2P08249 338 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itga5P11688 1053 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wfdc18P62810 74 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr324Q5NCC7 333 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc34a1Q60825 637 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glra1Q64018 457 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lcn12Q6JVL5 193 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Flrt1Q6RKD8 674 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pif1Q80SX8 650 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrtm1Q8K377 522 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnaja3Q99M87 480 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc24a3Q99PD7 645 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nqo2Q9JI75 231 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P2ry4Q9JJS7 361 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SigirrQ9JLZ8 409 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prok2Q9QXU7 128 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KantrA0A1W2P7I0 76 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930435E12RikA6X8Z9 381 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc18a3O35304 530 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gch1Q05915 241 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rasl12Q08AT1 266 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp729aQ4QQP3 973 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NelfaQ8BG30 530 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrtm1Q8BXQ3 356 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sulf2Q8CFG0 875 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r183Q8K3N5 305 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gnpnat1Q9JK38 184 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap4m1Q9JKC7 449 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MvkQ9R008 395 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pusl1A2ADA5 291 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnr1P47746 473 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcbd1P61458 104 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr876Q7TRE4 310 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clvs2Q8BG92 327 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lgi3Q8K406 548 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r35Q8R2E2 296 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 0610009B22RikQ8R3W2 140 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thoc3Q8VE80 351 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OcstampQ9D611 498 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfpl1Q9DB43 310 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fxyd1Q9Z239 92 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv13-85A0A075B666 115 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm39566A0A1B0GT45 1251 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a53A2AF28 346 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr782Q7TRI2 314 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp87Q8K2A4 540 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem51Q99LG1 249 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Magt1Q9CQY5 335 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss8Q9ESD1 342 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EdarQ9R187 448 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hebp2Q9WU63 205 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arxes1C0HK79 180 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arxes2C0HK80 180 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igh-3P01867 404 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtcraP0C6B2 199 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Muc13P19467 573 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fosl2P47930 326 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UqcrhP99028 89 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr89aQ8BS95 455 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx18Q91ZR2 614 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galnt11Q921L8 608 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MynnQ99MD8 610 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr943Q9EQ92 314 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm42543A0A0G2JET4 117 aa18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.6 ms