RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3gnt3Q5JCS9 372 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1500Q7TQQ3 311 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glrx5Q80Y14 152 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glt28d2Q8BML3 165 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trmt6Q8CE96 497 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neil1Q8K4Q6 389 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fahd1Q8R0F8 227 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem144Q8VEH0 348 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SostQ99P68 211 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspb2Q99PR8 182 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Commd4Q9CQ02 199 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spink12Q9D256 87 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lamp5Q9D387 280 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Samt4Q9D4X6 233 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slco1a4Q9EP96 670 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly96Q9JHF9 160 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Yipf7Q9JIM5 254 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gk2Q9WU65 554 aa9.16□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tstd1E9PY03 133 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr171G5E8J1 314 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasd1O35626 280 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh16O54909 317 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HckP08103 524 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UbcP0CG50 734 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabra2P26048 451 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MpzP27573 248 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pax6P63015 422 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neurog3P70661 214 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CebpdQ00322 268 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl7Q03366 97 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smim24Q0VG18 120 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam5Q3TTE0 751 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2rx3Q3UR32 397 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr331Q5NC44 324 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r223Q5SSA0 361 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc17a1Q61983 465 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bend6Q6PFX2 281 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr180Q7TS48 317 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pqlc1Q80XM9 271 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BspryQ80YW5 473 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scn3bQ8BHK2 215 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stac2Q8R1B0 408 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfam1Q8R4V1 264 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1342Q8VFY3 315 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr656Q8VGX9 329 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Egln3Q91UZ4 239 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q91V76 315 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Poldip2Q91VA6 368 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St3gal4Q91Y74 333 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cadm3Q99N28 396 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Metap1dQ9CPW9 335 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstk1Q9DCM2 226 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn12Q9ET43 244 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnaja4Q9JMC3 397 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RhcgQ9QXP0 498 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hipk2Q9QZR5 1196 aa9.15□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv9-2A0A0B4J1J4 117 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1224-ps1A3KGY4 311 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcnkO88874 554 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtnd4lP03903 98 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc2a2P14246 523 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myf6P15375 242 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnal1Q05A62 190 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scgb1a1Q06318 96 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm773Q3TML4 206 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnft2Q3UF64 445 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1463Q7TQR3 310 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1321Q7TQW4 319 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr874Q7TRE6 310 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr775Q7TRI4 312 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actbl2Q8BFZ3 376 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgp1Q8BHT7 391 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srsf12Q8C8K3 266 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc38a2Q8CFE6 504 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem5Q8VDX6 444 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znrf1Q91V17 227 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4931428L18RikQ9D4S9 127 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc4Q9D844 244 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Izumo2Q9DA16 220 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3GNT2Q9Z222 397 aa9.14□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav7n-5A0A075B604 112 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5072A2AHM1 344 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r224E9PWK2 298 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11009F7CWA7 138 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr417F8VQB1 309 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r58K7N6V2 862 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem178bM0QWJ9 172 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brs3O54798 399 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnj15O88932 375 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 77.4 ms