RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	CD46	P15529	392 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF17	P17021	662 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CD200	P41217	278 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	MSMO1	Q15800	293 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CT55	Q8WUE5	264 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	AP4M1	O00189	453 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DTYMK	P23919	212 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SNCA	P37840	140 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	GNG3	P63215	75 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SAP25	Q8TEE9	199 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX22	Q96L94	193 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	OR3A1	P47881	315 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CCL20	P78556	96 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HEXA	P06865	529 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	COX6A1	P12074	109 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HLA-G	P17693	338 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ERVS71-1	P61550	626 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	RND3	P61587	244 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ARV1	Q9H2C2	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SHISA7	A6NL88	538 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	PSMB3	P49720	205 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF212	Q495C1	297 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	FGF16	O43320	207 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	CATR1	Q13166	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	PROB1	E7EW31	1015 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525		F8VVB4	439 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525		F8VWA3	439 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	SCGB1D1	O95968	90 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TRGC2	P03986	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	CHRNA7	P36544	502 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIB1	Q96RU8	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TSTD3	H0UI37	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	SH2D1B	O14796	132 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	SYNGR2	O43760	224 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	OPN1MW	P04001	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	DANCR	P0C864	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-223	ENST00000639525	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79

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