RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612154.4

SORCS1-209, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SORCS1, Length 6,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-209ENST00000612154 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CLLU1Q5K131 121 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF561Q8N587 486 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ACSM4P0C7M7 580 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ERVFC1-1P60608 527 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 NRN1LQ496H8 165 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TM4SF20Q53R12 229 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 UPK3AO75631 287 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TBR1Q16650 682 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.8□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ADAM11O75078 769 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TGFAP01135 160 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CRYBB2P43320 205 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 DEFA6Q01524 100 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 SPINK9Q5DT21 86 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 IL22RA2Q969J5 263 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 A0A1B0GTL3 188 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RGS13O14921 159 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 G0S2P27469 103 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 FCER1GP30273 86 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 AESQ08117 197 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 FAM209BQ5JX69 171 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TSPAN2O60636 221 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 SFT2D2O95562 160 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TFPI2P48307 235 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 GNG4P50150 75 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 COL4A5P29400 1685 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 BMPR1BO00238 502 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 KCNAB3O43448 404 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TSPOP30536 169 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 LTBRP36941 435 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 KIAA0040Q15053 153 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 KHDC3LQ587J8 217 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TCAPO15273 167 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 REG1BP48304 166 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 OR4A5Q8NH83 315 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 C16orf92Q96LL3 132 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CHST5Q9GZS9 411 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 PTPRFP10586 1907 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 NINQ8N4C6 2090 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.79□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 G3V3Q6 166 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 H3BP45 60 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 J3KRW8 73 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 PSG4Q00888 419 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 TMED6Q8WW62 240 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 PLPP2O43688 288 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 OR2A4O95047 310 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 DCTDP32321 178 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 FAM222BQ8WU58 562 aa5.78□□□□□ -1.48
SORCS1-209ENST00000612154 OR2A7Q96R45 310 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms