RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596172.1

ZNF558-204, Transcript of zinc finger protein 558, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF558, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558-204ENST00000596172 OMGP23515 440 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 CHATP28329 748 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 GDNFP39905 211 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 ACTG1P63261 375 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 DYRK2Q92630 601 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 CHIAQ9BZP6 476 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 OR51E2Q9H255 320 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 VGLL3A8MV65 326 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 AIPO00170 330 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 IGLV1-47P01700 117 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 OR10A3P58181 314 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 ZNF596Q8TC21 504 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 KCTD7Q96MP8 289 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 KCNK15Q9H427 330 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 RAB22AQ9UL26 194 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 BTBD17A6NE02 478 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 C15orf65H3BRN8 121 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 GADD45AP24522 165 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 HTR1DP28221 377 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 PRRX1P54821 245 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 CLDN12P56749 244 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 HES5Q5TA89 166 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 SSX3Q99909 188 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 NICN1Q9BSH3 213 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 RAB9BQ9NP90 201 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 HSF4Q9ULV5 492 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF558-204ENST00000596172 A0A0A6YYD4 124 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 UBE2QL1A1L167 161 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 NOTOA8MTQ0 251 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 SSTR5P35346 364 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 DYNLT3P51808 116 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 FOXL1Q12952 345 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 FAM189A2Q15884 450 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 C6orf183Q5T699 404 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 OR9G1Q8NH87 305 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 RFESDQ8TAC1 157 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 CCDC107Q8WV48 283 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 ARL11Q969Q4 196 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 PTX4Q96A99 478 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 DPM3Q9P2X0 92 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 F2RL2O00254 374 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TOR1AO14656 332 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 GPR137BO60478 399 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 RAB6AP20340 208 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 NFYBP25208 207 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 SSX2Q16385 188 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 OR4K15Q8NH41 348 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 PIFOQ8TCI5 191 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 YIPF6Q96EC8 236 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 POM121CA8CG34 1229 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 LEUTXA8MZ59 168 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 C12orf77C9JDV5 145 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 H3BUX3 64 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 SOCS1O15524 211 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 SPINT2O43291 252 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 CRYBA1P05813 215 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 SDC2P34741 201 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 TMEM50BP56557 158 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF558-204ENST00000596172 Q3ZCU0 254 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms