RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 DHDHQ9UQ10 334 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PI62 339 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CFHR3Q02985 330 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPK1Q13546 671 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SATL1Q86VE3 508 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SUMF2Q8NBJ7 301 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM104Q8NE00 496 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8NFD4 153 aa20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 GON7Q9BXV9 100 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PLSCR3Q9NRY6 295 aa20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf65H3BRN8 121 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3AP20336 220 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf84H3BNL1 204 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 FHL3Q13643 280 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00311Q8N616 119 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf3Q8WVX3 66 aa20.04■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB3O15480 346 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.03■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 RBM11P57052 281 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC107Q8WV48 283 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 JAM3Q9BX67 310 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC31A2O15432 143 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 F2RL1P55085 397 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CHATP28329 748 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11H1Q8NG94 326 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52N1Q8NH53 320 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD7Q96MP8 289 aa20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 ING4Q9UNL4 249 aa20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 SOX6P35712 828 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPHD1Q5U4P2 390 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8H1Q8NGG4 311 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOZ3Q8TDC0 251 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL9Q9H1A3 318 aa19.99■□□□□ 0.79
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