RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CENPO	Q9BU64	300 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	HES4	Q9HCC6	221 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	HMG20A	Q9NP66	347 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	STUB1	Q9UNE7	303 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PRX2	142 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FAM172BP	A6NC97	362 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		A6NJY4	79 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		K7N7A8	449 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PSPN	O60542	156 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ARL6IP5	O75915	188 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR2H2	O95918	312 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF728	P0DKX0	622 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CCL3L1	P16619	93 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SLC6A1	P30531	599 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	BRS3	P32247	399 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ARHGDIB	P52566	201 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	DLX6	P56179	175 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GPR50	Q13585	617 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF273	Q14593	569 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TRAM1	Q15629	374 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GRK1	Q15835	563 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PLA1A	Q53H76	456 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		Q6ZS46	218 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TMEM104	Q8NE00	496 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	UBALD1	Q8TB05	177 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	YIPF6	Q96EC8	236 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	METTL9	Q9H1A3	318 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SSR3	Q9UNL2	185 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	hADV38S2	A0JD32	116 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		M0QZK8	103 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	DEGS1	O15121	323 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	AIRE	O43918	545 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RAMP3	O60896	148 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CHRM2	P08172	466 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MGMT	P16455	207 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	HTR2C	P28335	458 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR3A1	P47881	315 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NCS1	P62166	190 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	AES	Q08117	197 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RAB11B	Q15907	218 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	LTC4S	Q16873	150 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		Q6P435	159 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OSR2	Q8N2R0	312 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PXT1	Q8NFP0	134 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NDNF	Q8TB73	568 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NEK7	Q8TDX7	302 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF714	Q96N38	554 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NICN1	Q9BSH3	213 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		U3KQK5	164 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		A0A0A6YYD4	124 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	UBE2QL1	A1L167	161 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	SH2D1B	O14796	132 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	ZNF737	O75373	536 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	RAB3B	P20337	219 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	LMO1	P25800	156 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	HTR1D	P28221	377 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
CS-233	ENST00000552688	SDC2	P34741	201 aa		5.46	□□□□□ -1.54

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