RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658		Q9N2K0	584 aa		9.83	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		9.83	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CALY	Q9NYX4	217 aa		9.83	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	OPN4	Q9UHM6	478 aa		9.83	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TRDC	B7Z8K6	153 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	C22orf46	C9J442	243 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ORC5	O43913	435 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	SSX5	O60225	188 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	FCN3	O75636	299 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF728	P0DKX0	622 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CD40LG	P29965	261 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GDNF	P39905	211 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	OR3A3	P47888	321 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R46	P59540	309 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF273	Q14593	569 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	HOGA1	Q86XE5	327 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GAPT	Q8N292	157 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GALM	Q96C23	342 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CYYR1	Q96J86	154 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	SOST	Q9BQB4	213 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC32	Q9BV29	185 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ITPR2	Q14571	2701 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658		A0A096LNT2	108 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	FABP7	O15540	132 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	HSPA12A	O43301	675 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	FCER2	P06734	321 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CCL3L1	P16619	93 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GATA3	P23771	443 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	SSTR5	P35346	364 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	PPP5C	P53041	499 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R19	P59542	299 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	HMGN3	Q15651	99 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	LTC4S	Q16873	150 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ACTBL2	Q562R1	376 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	MFSD4A	Q8N468	514 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CORO2A	Q92828	525 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	GINS4	Q9BRT9	223 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	KLK11	Q9UBX7	282 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	PDZD2	O15018	2839 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	C12orf77	C9JDV5	145 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658		M0R1W7	72 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TGFA	P01135	160 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	HBZ	P02008	142 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	CTXN2	P0C2S0	81 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	NFYB	P25208	207 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ERVFRD-1	P60508	538 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	OR52W1	Q6IF63	320 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZS49	121 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	RFESD	Q8TAC1	157 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM186	Q96B77	213 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	KIRREL1	Q96J84	757 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	KPTN	Q9Y664	436 aa		9.8	□□□□□ -0.84
DDB1-223	ENST00000543658	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84	6e-9	■■■■□ 19.7
DDB1-223	ENST00000543658	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84

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