RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ZP1P60852 638 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ELP2Q6IA86 826 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CCDC190Q86UF4 302 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LYPD6Q86Y78 171 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TEX45Q8NA69 505 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 AQP3Q92482 292 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SNAPC3Q92966 411 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SLAMF9Q96A28 289 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR2V2Q96R30 315 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CCDC32Q9BV29 185 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CUBNO60494 3623 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 H0YL77 283 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SH2D1BO14796 132 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MLNRO43193 412 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CTAG2O75638 210 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-46P01743 117 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CD55P08174 381 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PRKACAP17612 351 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 EDN2P20800 178 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CDK2P24941 298 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 VEGFCP49767 419 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PPOXP50336 477 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DEFA1P59665 94 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DEFA3P59666 94 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 AP3S2P59780 193 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FGF12P61328 243 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ZNF154Q13106 437 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 KCNJ8Q15842 424 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MPV17LQ2QL34 196 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 Q5PR19 223 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 HACD4Q5VWC8 232 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TRIQKQ629K1 86 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZR03 302 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZTK2 550 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CALHM1Q8IU99 346 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR8H2Q8N162 312 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 POC1AQ8NBT0 407 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 RAB3CQ96E17 227 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TM2D1Q9BX74 207 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LIME1Q9H400 295 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 BANF2Q9H503 90 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PALMDQ9NP74 551 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 RNF7Q9UBF6 113 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 NPTNQ9Y639 398 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ARID1AO14497 2285 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CENPXA8MT69 81 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SULT1C2O00338 296 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 DEGS1O15121 323 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CTDSPLO15194 276 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SYNGR1O43759 233 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GLAP06280 429 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PGA5P0DJD9 388 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 BCL3P20749 454 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 FUT3P21217 361 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GLRA1P23415 457 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GABRR1P24046 479 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PRSS3P35030 304 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CFHR2P36980 270 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CBX5P45973 191 aa6.08□□□□□ -1.44
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