RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.76□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 EDARQ9UNE0 448 aa4.76□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 ESPL1Q14674 2120 aa4.76□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 KALRNO60229 2985 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 BSNQ9UPA5 3926 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PR80 420 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR5H1A6NKK0 313 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 H0YIZ8 118 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAAR5O14804 337 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 XRCC2O43543 280 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRYAAP02489 173 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM225BP0DP42 221 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX5AP20674 150 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GABRR1P24046 479 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFA5Q01523 94 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RSU1Q15404 277 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSC22D1Q15714 1073 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ASCL4Q6XD76 172 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SGPP2Q8IWX5 399 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MAFIPQ8WZ33 124 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 S100PBPQ96BU1 408 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 OR10C1Q96KK4 312 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGCCQ9H4X1 137 aa4.75□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM100Q9NV29 134 aa4.75□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 AGAP20933 346 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBG1P23258 451 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 DTYMKP23919 212 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHATP28329 748 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 GCH1P30793 250 aa4.74□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SELENOVP59797 346 aa4.74□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.74□□□□□ -1.65
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR31Q8NA23 367 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMED6Q8WW62 240 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 BORCS8Q96FH0 119 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYYR1Q96J86 154 aa4.74□□□□□ -1.65
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