RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	CA2	P00918	260 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GABRA3	P34903	492 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	BSPH1	Q075Z2	132 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	RAB11B	Q15907	218 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	COMMD1	Q8N668	190 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CHID1	Q9BWS9	393 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	KPTN	Q9Y664	436 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PTPRJ	Q12913	1337 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC169	A6NNP5	214 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	AKR7A2	O43488	359 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SPOP	O43791	374 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	RAP1GDS1	P52306	607 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SLC35F6	Q8N357	371 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IL22	Q9GZX6	179 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		0.16	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	C11orf86	A6NJI1	115 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	LY6H	O94772	140 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	LTA	P01374	205 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	CD200	P41217	278 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	GCLM	P48507	274 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	RHOA	P61586	193 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952		Q6ZTI0	123 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	MBOAT7	Q96N66	472 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	UPK3B	Q9BT76	320 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		0.15	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952		C9J4A7	227 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952		K7EQS6	105 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	HCRT	O43612	131 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	PDCD6	O75340	191 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	CD8A	P01732	235 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ANXA8	P13928	327 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2H1	P32780	548 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	RAB2A	P61019	212 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952		Q96M85	177 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	BIRC8	Q96P09	236 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	VAT1	Q99536	393 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL15	Q9H469	300 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	CRLF2	Q9HC73	371 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	NSD2	O96028	1365 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		0.14	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM250	H0YL14	139 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	FGF4	P08620	206 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	SLC2A1	P11166	492 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	PSMC5	P62195	406 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	HOXC5	Q00444	222 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	PDGFRL	Q15198	375 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	GUSBP1	Q15486	140 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		0.13	□□□□□ -2.39
TTC3-222	ENST00000491952	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		0.13	□□□□□ -2.39

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