RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PP11	408 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	AIRE	O43918	545 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY14	Q15391	338 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		Q96M66	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ODAM	A1E959	279 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GLIPR1	P48060	266 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	EFNB2	P52799	333 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	HES5	Q5TA89	166 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N2B8	174 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	AIP	O00170	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CA11	O75493	328 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ARG1	P05089	322 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CD34	P28906	385 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GFI1	Q99684	422 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087X0M5	115 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GX30	115 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNAB3	O43448	404 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM127	O75204	238 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD6	O75340	191 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	GZMH	P20718	246 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	COX7A1	P24310	79 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SDC2	P34741	201 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10A3	P58181	314 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NDX4	124 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR1D	P28221	377 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	GLP1R	P43220	463 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN12	P56749	244 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CFHR4	Q92496	578 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ2	Q96H96	371 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB6A	P20340	208 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	QRFP	P83859	136 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MXD1	Q05195	221 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZTK2	550 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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