RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	MMP23A	O75900	390 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	SCGN	O76038	276 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ARG1	P05089	322 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	GNB3	P16520	340 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	SSTR5	P35346	364 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	UBALD1	Q8TB05	177 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019		A0A0U1RQK1	487 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	RAB27B	O00194	218 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	TOR1A	O14656	332 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	SPINT2	O43291	252 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	TCF21	O43680	179 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ORC5	O43913	435 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	CD3G	P09693	182 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	CGB3	P0DN86	165 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	CGB7	P0DN87	165 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	GDNF	P39905	211 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	RIPPLY3	P57055	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	SPCS2	Q15005	226 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	GAPT	Q8N292	157 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM34-208	ENST00000485019	ABCA1	O95477	2261 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	C12orf77	C9JDV5	145 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	SAA4	P35542	130 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	SOX6	P35712	828 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	CDNF	Q49AH0	187 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	MIDN	Q504T8	468 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	MZT2A	Q6P582	158 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	AP3S1	Q92572	193 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ACAN	P16112	2415 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	SERPINE3	A8MV23	424 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	MFNG	O00587	321 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	NAPSA	O96009	420 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	HBZ	P02008	142 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	TALDO1	P37837	337 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	GNG10	P50151	68 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	PRRX1	P54821	245 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	BAMBI	Q13145	260 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	OR1L1	Q8NH94	360 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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