RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 AP4M1O00189 453 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 EI24O14681 340 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 MYF6P23409 242 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 EBI3Q14213 229 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GALEQ14376 348 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DS1Q14954 304 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ELP2Q6IA86 826 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TMEM104Q8NE00 496 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ARL11Q969Q4 196 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RITA1Q96K30 269 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 S1PR3Q99500 378 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 G3V318 75 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ALPLP05186 524 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RAB3AP20336 220 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CNTFRP26992 372 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF134P52741 427 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CFHR3Q02985 330 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 FOXE3Q13461 319 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 IL13RA2Q14627 380 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF529Q6P280 563 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 PRR18Q8N4B5 295 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 COMMD1Q8N668 190 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 PXT1Q8NFP0 134 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR8U1Q8NH10 309 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 KCTD7Q96MP8 289 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RHOFQ9HBH0 211 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RAMP3O60896 148 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 MOSP00540 346 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 FCGR1AP12314 374 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GABRB1P18505 474 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SERPINA2P20848 420 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GNB1P62873 340 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR11H1Q8NG94 326 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR52N1Q8NH53 320 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR1L1Q8NH94 360 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 NEK7Q8TDX7 302 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TMEM212A6NML5 194 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 C12orf77C9JDV5 145 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 MPZL2O60487 215 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 IGHG4P01861 327 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 MT-ND4P03905 459 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 VDAC1P21796 283 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SLC6A1P30531 599 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 VHLP40337 213 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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