RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10K2Q6IF99 312 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 PNKDQ8N490 385 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF596Q8TC21 504 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 NICN1Q9BSH3 213 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR51E2Q9H255 320 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF212BA8MTL3 300 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV4-59P01825 116 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLDN12P56749 244 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM189A2Q15884 450 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 C6orf183Q5T699 404 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q6ZPA2 131 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR5R1Q8NH85 324 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 C17orf50Q8WW18 174 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 DYRK2Q92630 601 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CYYR1Q96J86 154 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CENPOQ9BU64 300 aa6.72□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB9BQ9NP90 201 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETAA1Q9NY74 926 aa6.72□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 C12orf77C9JDV5 145 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 LY6LH3BQJ8 138 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 OMGP23515 440 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 SDC2P34741 201 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF137PP52743 207 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 EFNB2P52799 333 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 LOXL3P58215 753 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 UTF1Q5T230 341 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 HES5Q5TA89 166 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB22AQ9UL26 194 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETV7Q9Y603 341 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A0B4J203 849 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1W2PRD5 423 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1W2PRF3 423 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1W2PRM7 423 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM89A2RUT3 159 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB27BO00194 218 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 SOCS1O15524 211 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 AIREO43918 545 aa6.7□□□□□ -1.34
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