RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 DPM3Q9P2X0 92 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC42Q9Y546 428 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 LEUTXA8MZ59 168 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 F2RL2O00254 374 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC22A1O15245 554 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 CA11O75493 328 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 BPNT1O95861 308 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 IGLV1-47P01700 117 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 VSIG8P0DPA2 414 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SSTR5P35346 364 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMD7P51665 324 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 DYNLT3P51808 116 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 Q6ZSV7 163 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 DTX3Q8N9I9 347 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 OR9G1Q8NH87 305 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF114Q9Y508 228 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 CCRL2O00421 344 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC17A2O00624 439 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PDCD6O75340 191 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPAN9O75954 239 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 MT-ND4P03905 459 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 CD37P11049 281 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SSX1Q16384 188 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 LTC4SQ16873 150 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf183Q5T699 404 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SPARTQ8N0X7 666 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01006Q8NI28 216 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 RFESDQ8TAC1 157 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PIFOQ8TCI5 191 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC107Q8WV48 283 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL11Q969Q4 196 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 C16orf95Q9H693 158 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 TCF19Q9Y242 345 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PDCD5O14737 125 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 ORC5O43913 435 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 ARSBP15848 533 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 MYL9P24844 172 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMB9P28065 219 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 BRS3P32247 399 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB11BQ15907 218 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10K2Q6IF99 312 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 MMP28Q9H239 520 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 V9GY05 133 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-205ENST00000466097 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2QL1A1L167 161 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 OOSP1A8MZH6 123 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 J3QR06 171 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 SPINT2O43291 252 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 GALP22466 123 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 MNDAP41218 407 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB13P51153 203 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF773Q6PK81 442 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4K15Q8NH41 348 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 TM2D1Q9BX74 207 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 PSG11Q9UQ72 335 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 A6NDX4 124 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 C15orf65H3BRN8 121 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 CHST1O43916 411 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3-7P01780 117 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 CHATP28329 748 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 GNG10P50151 68 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC119Q13432 240 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 MADCAM1Q13477 382 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 P2RY14Q15391 338 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms