RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	DYRK2	Q92630	601 aa		14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	NICN1	Q9BSH3	213 aa		14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.41	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	ODF3B	A8MYP8	253 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902		H3BUX3	64 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	IL1A	P01583	271 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-7	P01780	117 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	QRFP	P83859	136 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	FAM189A2	Q15884	450 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	UBALD1	Q8TB05	177 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF596	Q8TC21	504 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	ARL11	Q969Q4	196 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	MALSU1	Q96EH3	234 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	AJUBA	Q96IF1	538 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	KIRREL1	Q96J84	757 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		14.4	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	TMEM89	A2RUT3	159 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GPR137B	O60478	399 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GLA	P06280	429 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CGB3	P0DN86	165 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CGB7	P0DN87	165 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GADD45A	P24522	165 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	HTR1D	P28221	377 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	PRRX1	P54821	245 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LY6E	Q16553	131 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	PRR18	Q8N4B5	295 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR5R1	Q8NH85	324 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LEAP2	Q969E1	77 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TM2D1	Q9BX74	207 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		14.39	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	IFITM5	A6NNB3	132 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CA11	O75493	328 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	HKR1	P10072	659 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CHAT	P28329	748 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CYYR1	Q96J86	154 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	KCTD7	Q96MP8	289 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		14.38	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SOCS1	O15524	211 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	VEGFC	P49767	419 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GNG10	P50151	68 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	MXD1	Q05195	221 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	FOXL1	Q12952	345 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	C6orf183	Q5T699	404 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR9G1	Q8NH87	305 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	RAB9B	Q9NP90	201 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	RAB22A	Q9UL26	194 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		14.37	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		A0A0A6YYD4	124 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		A0A0B4J203	849 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SPINT2	O43291	252 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	ORC5	O43913	435 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CD34	P28906	385 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SDC2	P34741	201 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	RAB13	P51153	203 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	UTF1	Q5T230	341 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TPRA1	Q86W33	373 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	C3orf56	Q8N813	242 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	SETD6	Q8TBK2	473 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	DPM3	Q9P2X0	92 aa		14.36	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		A0A087X0M5	115 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GX30	115 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	NOTO	A8MTQ0	251 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LEUTX	A8MZ59	168 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	C12orf77	C9JDV5	145 aa		14.35	□□□□□ -0.11

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