RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR51I2Q9H344 312 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SLC22A20A6NK97 555 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM74A7A6NL05 159 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MSTNO14793 375 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SH2D1BO14796 132 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KLK10O43240 276 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KCNAB3O43448 404 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IFNA5P01569 189 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HLA-HP01893 362 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MT-ND4LP03901 98 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SERPINE2P07093 398 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR8U9P0C7N5 309 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PRKACAP17612 351 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CCNOP22674 350 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CD80P33681 288 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RAB5BP61020 215 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DRB3P79483 266 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SRYQ05066 204 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 GUK1Q16774 197 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HFEQ30201 348 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MIDNQ504T8 468 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NMSQ5H8A3 153 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 STX12Q86Y82 276 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM219AQ8IW50 185 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 GAPTQ8N292 157 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF561Q8N587 486 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TP53RKQ96S44 253 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PRR13Q9NZ81 148 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 A0A096LPE4 126 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPZ6 126 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SOX15O60248 233 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C1QTNF9P0C862 333 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ADCYAP1P18509 176 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 LMO1P25800 156 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RAB13P51153 203 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ARHGDIBP52566 201 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TMPRSS3P57727 454 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PMS2P11Q13670 270 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF146Q15072 292 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TGIF1Q15583 401 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGSF11Q5DX21 431 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PCSK4Q6UW60 755 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 VASH2Q86V25 355 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ERGIC1Q969X5 290 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CDH20Q9HBT6 801 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 COA4Q9NYJ1 87 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KIAA1456Q9P272 454 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM221AA4D161 298 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM166BA8MTA8 275 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.25□□□□□ -1.25
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