RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 OR8H3Q8N146 312 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 TFAP2CQ92754 450 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A14Q9HCY8 104 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 ZFP57Q9NU63 452 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 GNG12Q9UBI6 72 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 CKLFQ9UBR5 152 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-204ENST00000459646 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PP11 408 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PPI3 338 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 AIPO00170 330 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINT2O43291 252 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FGF16O43320 207 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 LIMS3P0CW19 117 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 LIMS4P0CW20 117 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GTF2F2P13984 249 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 DCKP27707 260 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 THBS3P49746 956 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 MED21Q13503 144 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 XAF1Q6GPH4 301 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX38Q6PEX7 206 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF695Q8IW36 515 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 STPG2Q8N412 459 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4K15Q8NH41 348 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CYGBQ8WWM9 190 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 MUL1Q969V5 352 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GON7Q9BXV9 100 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 IRGMA1A4Y4 181 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2QL1A1L167 161 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CCL24O00175 119 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 AP4M1O00189 453 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHG2P01859 326 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 MT-ND4P03905 459 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 MAS1P04201 325 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 MYCNOSP40205 109 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 DGCR2P98153 550 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RIPK1Q13546 671 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR50Q13585 617 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR176Q14439 515 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB136Q30KP8 78 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC58Q4VC31 144 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 ASCL4Q6XD76 172 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 COMMD1Q8N668 190 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 APH1BQ8WW43 257 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GHSRQ92847 366 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM80Q96HE8 168 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 BANF2Q9H503 90 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB9BQ9NP90 201 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-204ENST00000459646 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms