RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	MT-ND4	P03905	459 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	QRFP	P83859	136 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	CITED1	Q99966	193 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A0A6YYD4	124 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A1W2PPE3	182 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	AIP	O00170	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC22A1	O15245	554 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	GABRA5	P31644	462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	GNG10	P50151	68 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	DYNLT3	P51808	116 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	P2RY14	Q15391	338 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705		Q6ZS46	218 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705		J3QR06	171 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	F2RL2	O00254	374 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	TOR1A	O14656	332 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	HTR2C	P28335	458 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAM1	Q15629	374 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	MMP28	Q9H239	520 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FUT3	P21217	361 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	EFNB2	P52799	333 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	PRRX1	P54821	245 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	CLDN12	P56749	244 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	LOXL3	P58215	753 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705		Q6ZPA2	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	GAPT	Q8N292	157 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-204	ENST00000395705	PDCD6	O75340	191 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	UBB	P0CG47	229 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CHAT	P28329	748 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CST11	Q9H112	138 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705		Q9H521	79 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC17A2	O00624	439 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC31A2	O15432	143 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	BPNT1	O95861	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	GZMH	P20718	246 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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