RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC42Q9Y546 428 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 VWFP04275 2813 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 A6NDX4 124 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 M0QZK8 103 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HSPB6O14558 160 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SPINT2O43291 252 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP23AO75900 390 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MT-ND4P03905 459 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HSMCR30P0CW71 290 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NFYBP25208 207 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HTR2CP28335 458 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GABARAPL2P60520 117 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 C6orf183Q5T699 404 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 STEAP3Q658P3 488 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB12Q6IQ22 244 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 BRICD5Q6PL45 260 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SVOPQ8N4V2 548 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CNBD2Q96M20 576 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 Q96M66 194 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP28Q9H239 520 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.86□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LY6LH3BQJ8 138 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 J3QR06 171 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 AIPO00170 330 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A1O15245 554 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PDCD6O75340 191 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM106CPP0CH98 169 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GALP22466 123 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 IL3RAP26951 378 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB7AP51149 207 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 EFNB2P52799 333 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MADCAM1Q13477 382 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZTK2 550 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8H3Q8N146 312 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GAPTQ8N292 157 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N2B8 174 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00311Q8N616 119 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL11Q969Q4 196 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RPEQ96AT9 228 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ETAA1Q9NY74 926 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PSG11Q9UQ72 335 aa6.85□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PP11 408 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CCRL2O00421 344 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC17A2O00624 439 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PDCD5O14737 125 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LPLP06858 475 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GDNFP39905 211 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB13P51153 203 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HERPUD1Q15011 391 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PLA1AQ53H76 456 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM104Q8NE00 496 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RFESDQ8TAC1 157 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SGCDQ92629 289 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 FCGR1BQ92637 280 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM203Q969S6 136 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 BANF2Q9H503 90 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.84□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.83□□□□□ -1.32
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf65H3BRN8 121 aa6.83□□□□□ -1.32
MT-TS1-201ENST00000387416 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
MT-TS1-201ENST00000387416 TXNL1O43396 289 aa6.83□□□□□ -1.32
MT-TS1-201ENST00000387416 CHST1O43916 411 aa6.83□□□□□ -1.32
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