RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384546.1

RNU6-1160P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1160, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1160P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LSM1O15116 133 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 COCHO43405 550 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 B3GALNT1O75752 331 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IFNW1P05000 195 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF728P0DKX0 622 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC25A16P16260 332 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 M6PRP20645 277 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PAFAH1B2P68402 229 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SSX2Q16385 188 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR10K2Q6IF99 312 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC35E3Q7Z769 313 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GTF2H4Q92759 462 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC00526Q96FQ7 95 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AMELYQ99218 206 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C20orf24Q9BUV8 137 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VCX3BQ9H321 246 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UNC79Q9P2D8 2635 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C9J4A7 227 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FTH1P02794 183 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 REG1BP48304 166 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C5orf64Q2M2E5 130 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RASL11AQ6T310 242 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ANGPTL6Q8NI99 470 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NT5CQ8TCD5 201 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCL17Q92583 94 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FMC1Q96HJ9 113 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TMEM70Q9BUB7 260 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 POMKQ9H5K3 350 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HHLA3Q9XRX5 114 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SBNO1A3KN83 1393 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HACD1B0YJ81 288 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DNAJB6O75190 326 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ALOX12BO75342 701 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GABRA3P34903 492 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IFNAR2P48551 515 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AKR1C2P52895 323 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BSPH1Q075Z2 132 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C10orf55Q5SWW7 151 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C1orf158Q8N1D5 194 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZBTB18Q99592 522 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MND1Q9BWT6 205 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LRRC40Q9H9A6 602 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HEATR9A2RTY3 570 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 M0QXV9 152 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DFFAO00273 331 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TCAPO15273 167 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TCF21O43680 179 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FCN3O75636 299 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GTF2H1P32780 548 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ELOBQ15370 118 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TEX36Q5VZQ5 186 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 EPGNQ6UW88 154 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 APRG1Q8IVJ8 170 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR11H6Q8NGC7 330 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TAMM41Q96BW9 452 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CDCA4Q9BXL8 241 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DSCAMO60469 2012 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR2F2O95006 317 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GCGP01275 180 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IFFO1Q0D2I5 559 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ANKDD1AQ495B1 522 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IDNKQ5T6J7 187 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UGT2A3Q6UWM9 527 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SUN5Q8TC36 379 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PATE1Q8WXA2 126 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CD209Q9NNX6 404 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DDIT4Q9NX09 232 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PGPA6NDG6 321 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 J3QLI3 93 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MT-CO2P00403 227 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LTAP01374 205 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 STOMP27105 288 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFA6Q01524 100 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF565Q8N9K5 539 aa-1.53□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms