RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 PRR13Q9NZ81 148 aa16■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 H7C1Q1 480 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 K7N7A8 449 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 PI3P19957 117 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH3B1P43353 468 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM50BP56557 158 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF92Q03936 586 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ARFRP1Q13795 201 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 EHFQ9NZC4 300 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 IGF2RP11717 2491 aa15.99■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SERPINE3A8MV23 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SOCS1O15524 211 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ERGIC1Q969X5 290 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 H3BQ15 152 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 AQP7O14520 342 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ZNHIT1O43257 154 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 XRCC2O43543 280 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 OR13C7P0DN81 318 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 COX5BP10606 129 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SPSB1Q96BD6 273 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 MEGF10Q96KG7 1140 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 RHOVQ96L33 236 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1456Q9P272 454 aa15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 RAD51DO75771 328 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 IL18BPO95998 194 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ARR3P36575 388 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 KHDC3LQ587J8 217 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM42Q69YG0 159 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 LRTM2Q8N967 370 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 Q8WTZ3 238 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 SPSB4Q96A44 273 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.97■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ACACBO00763 2458 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 C1QTNF9P0C862 333 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 GLIPR1P48060 266 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2KP61086 200 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 GAMTQ14353 236 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 OR8B8Q15620 311 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ZADH2Q8N4Q0 377 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 RAB39BQ96DA2 213 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 NEU1Q99519 415 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 ZZEF1O43149 2961 aa15.96■□□□□ 0.15
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GWJ7 208 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 KLK10O43240 276 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CCL2P13500 99 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CCNOP22674 350 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 OR10G4Q8NGN3 311 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TVP23CQ96ET8 276 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TRIB1Q96RU8 372 aa15.96■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 C5orf49A4QMS7 147 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 DVL1O14640 695 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 HSD17B6O14756 317 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MTCP1P56278 107 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 WFDC1Q9HC57 220 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 GLRX2Q9NS18 164 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms