RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 AGFG2O95081 481 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TUBG1P23258 451 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 KIR2DS4P43632 304 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 P2RY1P47900 373 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 KIR2DS1Q14954 304 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 MDP1Q86V88 176 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CACNG5Q9UF02 275 aa11.12□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 SLC22A20A6NK97 555 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TRDCB7Z8K6 153 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 KRASP01116 189 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CELA3BP08861 270 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 HOXC12P31275 282 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 EDDM3AQ14507 147 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF266Q14584 549 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 VHLLQ6RSH7 139 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 PLK3Q9H4B4 646 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 IGLV3-1P01715 115 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 BMP5P22003 454 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RAB11AP62491 216 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 BTNL8Q6UX41 500 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF98A6NK75 572 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CLDN1O95832 211 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RSG1Q9BU20 258 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TINAGQ9UJW2 476 aa11.11□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 H7C1Q1 480 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 MT-CO3P00414 261 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CD46P15529 392 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 FOXO1Q12778 655 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TESK1Q15569 626 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 OR2C1O95371 312 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 IL2RGP31785 369 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 GABRA2P47869 451 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 GNG3P63215 75 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 IL13RA2Q14627 380 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 C4orf17Q53FE4 359 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TRIB1Q96RU8 372 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 NUDT19A8MXV4 375 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 SNCAP37840 140 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RAB2AP61019 212 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 FGF12P61328 243 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF573Q86YE8 665 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 Q9N2K0 584 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 DUSP13Q9UII6 198 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.1□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 SOX15O60248 233 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CEACAM6P40199 344 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 LHX2P50458 406 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 IL15RAQ13261 267 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 OR8B8Q15620 311 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 MPV17LQ2QL34 196 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 Q6ZPA2 131 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 USF3Q68DE3 2245 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 H0YL77 283 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 DNPH1O43598 174 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 GFRA1P56159 465 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 HES3Q5TGS1 186 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.09□□□□□ -0.63
LRTM2-201ENST00000299194 SSX9Q7RTT3 188 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms