RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MaoaQ64133 526 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1277Q8VF41 303 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tstd3Q9D0B5 157 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TrilQ9DBY4 809 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EdarQ9R187 448 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tanc1Q0VGY8 1856 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv7-1A0A075B5S2 121 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 I0C0044D17RikA6PWL3 169 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21788J3QNH3 180 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nipsnap1O55125 284 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf2P15655 154 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P18533 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C5ar1P30993 351 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabrb1P50571 474 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr907Q7TRC7 310 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl7bQ921K9 202 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr957Q9EQB7 311 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn13Q9Z0S4 211 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6g6dQ9Z1Q3 135 aa11.34□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14444A2ARW3 426 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CatsperdE9Q9F6 805 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stc2O88452 296 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp13P10754 512 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GrprP21729 384 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr12P35412 334 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmp5P49003 452 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1cbP62141 327 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htr2bQ02152 479 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St8sia3Q64689 380 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a32Q8BMG8 316 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4922502D21RikQ8C634 189 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk13Q8CGR6 276 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r237Q8R296 289 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr829Q8VGX1 321 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 QprtQ91X91 299 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap4m1Q9JKC7 449 aa11.33□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1109A2AT96 312 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ntn1O09118 604 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crisp2P16563 243 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfdc18P62810 74 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acsf3Q3URE1 583 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk8Q61955 260 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r14dQ7TT52 146 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tox4Q8BU11 619 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec14l4Q8R0F9 403 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MetrnlQ8VE43 311 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr308Q8VFP2 308 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrg4Q9WTX4 115 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dock1Q8BUR4 1865 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcgr4A0A0B4J1G0 249 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr789A0A1L1SV77 312 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr419E9Q0Y7 313 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav13d-3J3QMG8 112 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ntsr1O88319 424 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkx2-1P50220 372 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 StumQ0VBF8 141 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PcnpQ6P8I4 178 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SergefQ80YD6 464 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Paqr8Q80ZE5 354 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cst6Q9D1B1 149 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4175D3YTW8 314 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mex3aG3UYU0 520 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01657 111 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc38a11Q3USY0 453 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lcn4Q62472 185 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DdiasQ6NZG4 898 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsun3Q8CCT7 348 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r66Q8K4I0 310 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ApehQ8R146 732 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr469Q8VF66 314 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1424Q8VFV1 313 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mid1ip1Q9CQ20 182 aa11.33□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo16Q5DU14 1919 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr548-ps1A0A1B0GSG0 314 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp6A8R0U0 136 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1218L7MU54 311 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bloc1s1O55102 125 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fkbp14P59024 211 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr453Q7TRV7 317 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tssk5Q8C1R0 372 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Commd1Q8K4M5 188 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpx6Q91WR8 221 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gk2Q9WU65 554 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ascl4M0QW46 144 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmb1O09061 240 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itgb2P11835 771 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Egr3P43300 387 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CamlgP49070 294 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uba52P62984 128 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1000Q7TR99 314 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cuedc1Q8R3V6 388 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.5 ms