RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q8NFD4 153 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RFESDQ8TAC1 157 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 AMBNQ9NP70 447 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DHDHQ9UQ10 334 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.76□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1W2PPE3 182 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SNTNA6NMZ2 147 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FGF16O43320 207 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGKV1D-33P01593 117 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGKV1-33P01594 117 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB3AP20336 220 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB7AP51149 207 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HES1Q14469 280 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HNF4GQ14541 408 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR8H3Q8N146 312 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CBR4Q8N4T8 237 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.75□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC01548A6NM66 108 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SERPINE3A8MV23 424 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CDRT1O95170 752 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HTR3BO95264 441 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHG2P01859 326 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCDC159P0C7I6 412 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LIMS3P0CW19 117 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LIMS4P0CW20 117 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SOX2P48431 317 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KCNJ3P48549 501 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB40BQ12829 278 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EBI3Q14213 229 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RSU1Q15404 277 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 XAF1Q6GPH4 301 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SATL1Q86VE3 508 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GPER1Q99527 375 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 P2RX4Q99571 388 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 JAM3Q9BX67 310 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IFT22Q9H7X7 185 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 COL7A1Q02388 2944 aa8.74□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HSD17B6O14756 317 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MAGEB3O15480 346 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYCNOSP40205 109 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 STPG2Q8N412 459 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q8N6K4 173 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 APH1BQ8WW43 257 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC29A1Q99808 456 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZFP57Q9NU63 452 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.73□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NUDT19A8MXV4 375 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C15orf65H3BRN8 121 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MPZL2O60487 215 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC6A1P30531 599 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 REG1BP48304 166 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MOB3BQ86TA1 216 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF695Q8IW36 515 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 COMMD1Q8N668 190 aa8.72□□□□□ -1.01
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q8N9W7 124 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms