RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	MIP	P30301	263 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	GABRA3	P34903	492 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR1D4	P47884	311 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TAF6	P49848	677 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CTBP2	P56545	445 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RAB38	P57729	211 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TAS2R20	P59543	309 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	GNG5	P63218	68 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC35A2	P78381	396 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HOXC5	Q00444	222 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HSD52	Q0P140	79 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RAB40B	Q12829	278 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	MYBPH	Q13203	477 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF266	Q14584	549 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RGN	Q15493	299 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HMGN3	Q15651	99 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	XAF1	Q6GPH4	301 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR10K2	Q6IF99	312 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BEST3	Q8N1M1	668 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	PGBD5	Q8N414	524 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM86B	Q8N661	226 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR4F5	Q8NH21	305 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BORCS7	Q96B45	105 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR4K3	Q96R72	315 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR2D2	Q9H210	308 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR51I2	Q9H344	312 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CWH43	Q9H720	699 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HES4	Q9HCC6	221 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	MMP26	Q9NRE1	261 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	GALP	Q9UBC7	116 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	POMT2	Q9UKY4	750 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	POMP	Q9Y244	141 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ASF1A	Q9Y294	204 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BTRC	Q9Y297	605 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ITSN1	Q15811	1721 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF724	A8MTY0	619 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	SPRY2	O43597	315 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TRIAP1	O43715	76 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	KBTBD11	O94819	623 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	TOX	O94900	526 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	REN	P00797	406 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-204	ENST00000577468	CD8A	P01732	235 aa		2.56	□□□□□ -2

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